齐齐哈尔工程学院工会委员会，成立于1993年。学校工会下设民主管理委员会、女职工委员会、经费审查委员会、组织部、宣传部、文体部，同时下辖8个基层工会：机电工程系基层工会、信息工程系基层工会、建筑管理工程系基层工会、康护工程系基层工会、基础部基层工会、马克思主义学院基层工会、齐工产教集团基层工会、机关基层工会。2022年，学校工会获评“全省创新职工之家”、学校应用型课程开发创新工作室获评“黑龙江省教科文卫体系统劳模和工匠人才创新工作室”；2023年，健康与护理系获评市“五一”巾帼标兵岗；2024年，学校获评全省工会系统“三星级”母婴爱心屋、齐齐哈尔市职工技能竞赛基地、学校“三全育人”创新工作室获评“齐齐哈尔市劳模和工匠人才创业工作室”、机电工程系获评“齐齐哈尔市工匠学院”。